2003年2月，陈映真在批判李登辉“皇民化”史观的《龌龊残暴的“武士道”和天皇意识形态》中，除了批判“武士道”和“丑恶的天皇意识形态”之外，也批判“在战后冷战和内战夹缝中猬生滋长的老皇民反民族分子的存在”，并且指出自古以来的铁则：“是奴才就不是主子！”日据五十年，殖民当局以“律令”或“敕令”为主的殖民地法（“外地法”）统治台湾人，相对于日本人，台湾人是“内地人”的“外地人”。然而，出于“法律上的无知”与“严重的台湾人劣等感”，李登辉等一些“老皇民余孽”却在“道德上极力崇扬殖民者，又相对极端蹧践自己民族（廖文毅上书美国的《台湾发言》中亦然），然后努力要按照殖民者的形象、思维与生活改造自己，千方百计要跻身于统治民族，以殖民者的偏见和歧视鄙视自己的民族”，从而“让小林善纪、中岛岭雄、石原慎太郎、藤井省三这一批狂肆无耻地公开要把台湾分裂出去，和台湾反民族分子唱和反华反动的日本人在台湾张狂跳梁”。他强调“物必自腐而虫生”，这是台湾人应该痛切反省清理的日本殖民统治遗留下来的深重的精神遗毒[62]。

与此同时，正是SARS（严重急性呼吸综合征）疫情流行期间。马偕医院一位周姓医师，虽然在院内医疗工作领域不曾接触SARS患者，旅游前又无病征，却在赴日观光途中发烧，回到台湾后被诊断疑似感染SARS。日本政府和记者借题发挥，对台湾如主人斥责下人般谴责。台湾当局的外事主管部门和马偕医院卑躬屈膝，被迫公开道歉。由“皇民老人”领导，口必称“台湾人的尊严”的某政团，受辱而不以为辱，在斥责周医师“乱来”的同时，却对日本记者咄咄逼人的斥责低调反应，甚至一有机会就将矛头指向中国大陆。

陈映真目睹这场令人感到屈辱难堪的事态发展过程，乃于5月20日写下《物必自腐而后虫生》，先是仗义说“周医师带‘煞’游日，绝对是无心造成的遗憾”，然后批判日本政府和人民未曾为其罄竹难书的战争犯罪说一声道歉，而台湾的记者、外事主管部门却一向唾面自干、噤若寒蝉。他沉痛地说，日本人可以“无忌惮侮辱”台湾，是因为“台湾有一些亲日、媚日的皇民遗老遗少，平时无限美化日本统治台湾的历史，和日本右翼齐唱侮华、反华曲调，实际上造成甚至日本右翼对台湾人民深刻的侮慢与不齿”。这次的马偕医师事件总体表现了“物必自腐而后虫生”的道理[63]。只是，不知何故，这篇文章当时未曾公开发表。

2005年，日本无条件投降、中国人民抗日战争暨世界反法西斯战争胜利、台湾回归祖国六十周年，《人间思想与创作丛刊》第9辑策划了“八·一五：记忆和历史”专辑，陈映真在《题解》中批评道：“当世界人民为反法西斯战争胜利大举纪念、反思之时，台湾漠然；亚洲各国为日本拒绝面对侵略历史而严厉谴责之际，台湾竟有人跑到靖国神社参拜；当多数中国人隆重庆祝抗日战争胜利之日，台湾却少有人记起这一天。难道这是个特别健忘的岛屿？这里是历史虚无的荒漠？”

他以“二·二八事件遭曲解成为台独运动的肇始，三十多万具亡魂为证的南京大屠杀被日本右翼妄言为虚构”为典型之例，论证“人民的记忆、民族的历史，往往遭当下政治意识形态的摆弄操纵”。然而，他“不相信人民没有记忆”，也“不接受消极的虚无史观”，而是“期待，通过实事求是的历史实证研究，找回遭扭曲、遭湮灭的人民记忆与斑斑史迹”。[64]

六、驱逐日本殖民主义的幽灵

2006年7月，陈映真在《人间思想与创作丛刊》第11辑“日读书界看蓝博洲”专辑发表《盼望日本大众端正对台湾的视角——祝贺蓝博洲〈幌马车之歌〉日译本的出版》的中文译文。这是他清理与批判日本殖民统治台湾的历史及意识的最后一篇。此前的6月，他受邀赴中国人民大学讲学，9月不幸中风，疗养十年，最终于2016年11月23日逝世。

陈映真于2016年11月22日14时39分在北京逝世，享年80岁。

时光飞逝。一转眼，映真先生离开我们已经9年了。然而，我们看到，他一生努力清理与批判的日本殖民主义的历史及其意识，不但未能被人们扫进历史的垃圾堆里，反而随着中国的日渐强盛，在作为战争加害者的日本与作为殖民受害者的台湾地区，随着毫无根据的反共的所谓“中国威胁”“台湾地位未定”“台湾有事即日本有事，日本有事即日美有事”等谬论的鼓吹、挑拨而更加肆虐危害。我们看到，关于日本作为侵略者犯下的罪行也在它的历史教科书中逐年淡化而体现出其殖民主义的本性。

写到这里，笔者刚好收到《新日本军国主义的新阶段》（台湾人间出版社2009年3月出版）一书作者纐缬厚2025年9月18日从日本发来的电子邮件，其中提到：“此书出版已久，其后日本外交防卫政策更趋向对美依附，日本自卫队亦持续与美国联手扩大对华施压。藉‘台湾有事’等宣传，日本新军国主义气焰愈发猖獗，参议院政党崛起等右倾趋势更日趋严重。为剖析此种现状，我将于本月底出版《非武装中立的现实主义》一书。本书提出核心质疑：日本是否应严守和平宪法，依循第九条条文，将非武装中立确立为外交防卫的基本方针？主张应停止徒然恫吓中国，并终止以防卫台湾为名与美国共同扩张军备的行径。”

是的，日本军国主义不但不是孤魂野鬼，而且它的幽灵一直都在台海上空徘徊，随时准备再度扑杀宝岛台湾。而台湾的“务实台独”当局竟变本加厉，以奴才之姿，迎向曾经殖民统治台湾人半个世纪的旧日主子。此乃真正的“台湾人的悲哀”吧！映真先生地下有知，定当为其心心系念的台湾同胞感到无法忍受的羞愧与痛心。